换一批灰毡毛忍冬MADS-box基因家族鉴定与CMB1基因克隆
Identification of the MADS-box gene family and cloning of the CMB1 gene in Lonicera macranthoides
摘要目的 鉴定灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides MADS-box家族基因并进行生物信息学分析与表达模式验证,克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬MADS-box家族成员CMB1 全长.方法 基于转录组数据,利用在线工具对灰毡毛忍冬MADS-box进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR验证MADS-box基因在不同品种中的表达模式,通过RT-PCR、RACE技术克隆湘蕾型和野生型灰毡毛忍冬CMB1基因全长.结果 28个灰毡毛忍冬MADS-box蛋白长度为89～359 aa,碱性蛋白占比85.7%,不稳定蛋白占比96.4%,亲水性蛋白占比 96.4%,均定位于细胞核,均为无跨膜结构的非分泌蛋白.转录组显示,与野生型比较,湘蕾型中 28个MADS-box基因有 17.86%表达下调,MIKCC型基因中有 18.75%表达下调.克隆得到在两个品种的灰毡毛忍冬花中高度特异性表达的CMB1基因全长,均包含一个738 bp的ORF,编码245个氨基酸.CMB1基因在两个品种的花中表达量存在显著差异(P<0.01),且与茎、叶相比,在花中高度特异性表达(P<0.01).结论 基于灰毡毛忍冬转录组数据,鉴定了 28个MADS-box家族基因,克隆得到湘蕾型与野生型灰毡毛忍冬CMB1 基因全长,为进一步研究灰毡毛忍冬花发育、优良表型形成的分子机制提供研究基础与理论依据.
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关键词
灰毡毛忍冬MADS-box基因家族表达分析CMB1基因基因克隆表型变异Lonicera macranthoidesMADS-box gene familyexpression analysisCMB1 genegene clonephenotypic variation
分类号
R28（中药学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1674-070X.2024.03.006
发布时间
2024-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82373992）
湖南省自然科学基金项目（2021JJ30497）
湖南省自然科学基金项目（2021JJ30515）
现代农业产业技术体系（CARS-21）
湖南中医药大学研究生创新训练项目（2022CX79）
湖南中医药大学研究生创新训练项目（2023CX152）
中药资源与开发（湖南省一流专业建设点）
湖南中医药大学重点学科中药学科(校行发规字号)
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