基于生物信息学的补气活血通络方对特发性肺间质纤维化的作用机制研究
Study on action mechanism of Buqi Huoxue Tongluo formula on idiopathic pulmonary fibrosis based on bioinformations
摘要目的 基于临床大样本基因芯片数据,确定补气活血通络方对特发性肺间质纤维化作用靶点和机制.方法 基于TCMSP数据库确定补气活血通络方的有效成分及作用靶点.利用Gene Expression Omnibusl(GEO)数据库的肺纤维化基因表达谱数据,构建加权基因共表达网络,确定肺纤维化发病的相关基因.将补气活血通络方的靶点基因与肺纤维化发病基因取交集,借助单因素cox回归分析筛选出生存相关的作用靶点,并通过GO与KEGG富集分析进行功能注释.结果 共得到13个补气活血通络方对于肺纤维化的作用靶点,进一步结合临床生存信息,确定出骨髓细胞白血病基因-1(myeloid cell leukemia-1,MCL1)与血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth facter A,VEGFA)为生存相关的中药复方靶点,其参与的生物学通路主要是核因子-κB(nuclear factor kappa B,NF-κB)通路、PI3K/Akt通路以及表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)通路.结论 补气活血通络方以 MCL1 及 VEGFA 为作用靶点,作用于 NF-κB 通路、PI3K/Akt 通路以及EGFR通路从而起到抗纤维化作用.
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