换一批
换一批醛脱氢酶18家族成员A1在食管癌细胞中结合的靶标及测序分析
Binding target and sequencing analysis of aldehyde dehydrogenase 18 family member A1 in esophageal cancer cells
摘要目的 研究醛脱氢酶 18 家族成员 A1(aldehyde dehydrogenase 18 family member A1,ALDH18A1)作为一种RNA结合蛋白在食管癌细胞(KYSE150细胞)中结合RNA的分子特征及对肿瘤生长的影响.方法 通过体外培养人食管鳞癌细胞(KYSE150细胞).同时,采用RNA免疫共沉淀技术研究细胞内RNA与蛋白结合情况,利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,分离纯化捕获的RNA.分析ALDH18A1结合RNA的分子特征,并且对ALDH18A1结合靶基因进行京都基因与基因组百科全书聚类分析.结果 蛋白质免疫印迹实验显示目的蛋白被抗体较好富集.ALDH18A1具有广泛的RNA结合活性,结合显著富集在编码区、内含子和5'非翻译区.ALDH18A1主要结合在RNA的UGUAAUC基序.聚类分析结果表明,ALDH18A1结合的RNA分子主要参与了在对焦点黏附、癌症的中心碳代谢、细胞周期、剪接体、RNA运输和泛素介导的蛋白水解等.结论 ALDH18A1能结合RNA分子,可在食管癌相关基因的表达过程以及相关的生物学过程过程中发挥作用.
更多相关知识
关键词
食管癌细胞醛脱氢酶18家族成员A1RNA结合蛋白RNA免疫共沉淀Esophageal cancer cellsaldehyde dehydrogenase 18 family member A1RNA binding proteinRNA immunocoprecipitation
栏目名称
论著
DOI
10.7507/1002-0179.202401287
发布时间
2024-09-13
基金项目
新疆医科大学研究生创新创业项目
新疆维吾尔自治区天山英才培养计划资助项目
新疆维吾尔自治区优秀博士后普通基金资助项目
- 浏览2
- 被引0
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
