换一批基于生物信息学分析预测和验证实验性自身免疫性心肌炎的关键基因
Identification and validation of crucial genes in experimental autoimmune myocarditis using bioinformatics analysis
摘要目的:研究实验性自身免疫性心肌炎(EAM)的分子机制,确定EAM的新生物标记物和靶点,为心肌炎的诊断和治疗提供新的见解.方法:通过差异表达分析GEO数据库中EAM相关数据集GSE155423,筛选出差异表达基因(DEGs).利用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络.利用Cytohubba筛选出枢纽基因.利用支持向量机-递归特征消除(SVM-RFE)和随机森林(RF)机器学习算法筛选枢纽基因中的关键基因.最后,这些枢纽基因在脂多糖(LPS)诱导的心肌损伤模型中得到了进一步验证.结果:在GSE155423中确定9个枢纽基因.进一步发现了两个关键基因:Cxcl9和Cxcl10.通过实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应和蛋白质印迹分析验证了Cxcl10在LPS诱导的心肌损伤模型中的高表达.结论:Itgax、Ccl5、Cxcl10、Ifng、Csf2、Cxcl9、Il6、Foxp3和Il1b与EAM的发生发展密切相关.Cxcl10基因可能是EAM发生机制中的一个关键靶点.
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栏目名称
DOI
10.14188/j.1671-8852.2023.0697
发布时间
2025-03-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（82070425）
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