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质谱代谢组学数据预处理方法研究

Research on the preprocessing method of mass metabolomics data

摘要建立质谱代谢组学数据的预处理方法.采用K近邻法、连续K近邻法、多重插补法进行缺失值填补,应用正态、极差、均值、中位数、中心化、总强度标准化等方法进行数据预处理,以正态性检验、模型拟合能力、预测能力、分类效果对预处理方法进行评价.通过模型拟合能力、预测能力、分类效果检验评价,缺失值填补3种方法差别较小;直观分析确定多重插补法,正态性检验结果表明,经过缺失值插补后数据呈偏态分布;极差标准化后,数据呈现正态分布.6种标准化方法的评价结果显示,极差标准化后数学建模的拟合能力、预测能力和分类效果较好.应用多重插补缺失值填补-极差标准化法得到的质谱代谢组学数据可以进行数据模式识别.

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分类号 O657.6
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DOI 10.3969/j.issn.1008-6145.2018.05.025
发布时间 2018-10-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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