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    首页 > 化学物理学报 > 用于真实蛋白质结构预测的一种新的优化方法

    用于真实蛋白质结构预测的一种新的优化方法

    A New Minimization Method for Real Protein Folding Prediction

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    摘要用"相对熵"作为优化函数,提出了一个有效快速的折叠预测优化算法.使用了非格点模型,预测只关心蛋白质主链的走向.其中只用到了蛋白质主链上的两两连续的Cα原子间的距离信息以及20种氨基酸的接触势的一个扩展形式.对几个真实蛋白质做了算法测试,预测的初始结构都为比较大的去折叠态,预测构象相对于它们天然结构的均方根偏差(RMSD)为5～7 A.从原理上讲,该方法是对能量优化的改进.

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    作者 卢本卓 [1] 王存新 [2] 王宝翰 [3] 学术成果认领
    作者单位 中国科学技术大学天文与应用物理系,合肥,230026 [1] 北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100022 [2] 中国科学院生物物理研究所,北京,100101 [3]
    关键词 蛋白质折叠预测相对熵优化方法非格点模型
    分类号 Q615
    栏目名称 研究论文
    DOI 10.3969/j.issn.1674-0068.2003.02.009
    发布时间 2004-01-08
    基金项目
    国家自然科学基金
    提交
    • 浏览0
    • 被引23
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    化学物理学报

    化学物理学报

    2003年16卷2期

    117-121页

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