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用界面几何约束的多起点蒙特卡罗方法对蛋白质/短肽识别体系的对接计算

Docking of Protein- peptide Segment Complexes with Multi - start Monte Carlo Procedure Restrained by Surface Geometry Match

摘要提出了一个界面几何约束的多起点蒙特卡罗构象搜索方法,并把这个方法用于三个丝氨酸蛋白酶/短肽抑制剂体系的刚性、部分柔性和全部柔性对接计算中.我们的方法成功地预测出了接近晶体结构的配体构象.与没有几何约束相比,我们的几何约束蒙特卡罗方法显示出了更好的收敛灾行

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