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激光捕获显微切割联合SELDI蛋白质芯片筛选肺腺癌早期诊断标志蛋白

Application of Laser Capture Microdissection and Surface-enhanced Laser Desorption Ionization Time-of-flight Mass Spectrometry to Screen Biomarkers for Early Diagnosis of Lung Adenocarcinoma

摘要目的 探讨应用激光显微切割(LCM)联合表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱蛋白质芯片(SEL,DI-TOF-MS)及模式识别分类技术-支持向量机(SVM)筛选肺腺癌标志蛋白的可行性.方法 将6例新鲜肺腺癌组织标本及其配对的4例正常肺组织制备8μm厚度冰冻切片,改良HE染色;用LCM技术选择性获取同质腺癌细胞和配对正常肺组织细胞.应用PBSⅡ+型SELDI-TOF-MS分析仪(IMAC芯片)分析腺癌及其配对正常细胞的蛋白质表达谱,比对差异点;应用SVM筛选并验证候选标志蛋白的判别效能.结果 平均每个LCM帽子的激光点数约4000 shots,获得了同质性>95%的肿瘤细胞和正常细胞.比较腺癌和配对正常细胞之间的SELDI谱图,共筛选出84个蛋白峰.将差异最明显的10个蛋白峰作为候选标志蛋白.和正常组织相比,6种蛋白在腺癌中呈低表达,4种蛋白在腺癌中呈高表达.差异有统计学意义(P<0.05).初步筛选出3191 m/z蛋白峰作为腺癌诊断标志蛋白.结论 LCM联合SEIDI蛋白质芯片技术有可能筛选出敏感性高、特异性强的肺腺癌标志蛋白;该技术将为肺腺癌早期诊断研究提供新的强有力的工具.

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分类号 R734.2
栏目名称 技术与方法
DOI 10.3969/j.issn.1672-173X.2009.01.038
发布时间 2009-04-03
基金项目
国家自然科学基金 教育部新世纪优秀人才支持计划
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四川大学学报(医学版)

四川大学学报(医学版)

2009年40卷1期

157-161页

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