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肾癌中THBS家族基因表达数据生物信息学挖掘

Bioinformatics mining of THBS family gene expression data in renal carcinoma

摘要目的:应用生物信息学方法挖掘血小板反应蛋白(THBS)家族各成员与肾癌的关系,预测肾癌治疗、诊断及预后新的标志物.方法:运用ONCOMINE、GEPIA、KM-plotter及cBioPortal等数据库对THBS家族在肾癌中的mRNA表达水平及预后生存率进行分析,使用GeneMANIA及DAVID数据库对THBS家族的功能及生物途径进行分析.结果:与正常组织相比,THBS1/THBS2/THBS3 在肾癌中的mRNA表达水平下调,且在肾癌肿瘤病理分期中,THBS2/THBS3/THBS5 的表达情况与病理分期具有相关性,低水平THBS2/THBS3/THBS4/THBS5 或高水平THBS1 的肾癌患者预计具有较高总生存率(OS).结论:THBS1/THBS2/THBS3 可能是肾癌患者精准治疗的潜在目标,THBS2/THBS3/THBS4/THBS5 可作为肾癌预后新的标志物.

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作者 刘红云 [1] 杨婷 [1] 李国庆 [1] 孟莉娟 [2] 学术成果认领
作者单位 南华大学衡阳医学院基础医学院细胞生物学与遗传学教研室,湖南 衡阳 421001 [1] 南华大学衡阳医学院附属第二医院超声医学科,湖南 衡阳 421001 [2]
分类号 R737.11
栏目名称 论著
DOI 10.19296/j.cnki.1008-2409.2023-05-005
发布时间 2023-12-05
基金项目
湖南省教育厅科学研究项目 湖南省自然科学基金项目 衡阳市科学技术项目
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