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基于微卫星的泥蚶5个地理群体遗传多样性分析

Microsatellite analysis of genetic diversity in five geographic populations of Tegillarca granosa

摘要为了研究泥蚶不同地理群体的系统发育关系和遗传多样性, 运用微卫星 DNA 标记, 对浙江温州(ZJ)、山东日照(SD)、韩国釜山(KR)、广西企沙(GX)、海南海口(HN)等 5 个泥蚶地理群体进行了 17 个基因位点的遗传多样性分析.结果显示, 从 17 对引物中共检测出 115 个等位基因, 每个位点等位基因数(Na) 2~12 个.有效等位基因数(Ne)为 1.192~7.849, 平均观测杂合度(Ho)为 0.430~0.516, 平均期望杂合度(He)为 0.573~0.656, 5 个群体的平均多态信息含量(PIC)为 0.525~0.608.Hardy-Weinberg 平衡检验表明, 51.2%的微卫星位点偏离平衡状态(P<0.05).5 个群体间的种群遗传分化系数(FST)为 0.012~0.062,呈现出较低的遗传分化.UPMGA 聚类分析表明, 浙江群体和韩国群体首先聚在一起, 亲缘关系最近,然后与海南群体聚合; 广西群体和山东群体亲缘关系较近, 聚为一支, 然后与上面三个群体聚合.

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作者 程雪艳 [1] 滕爽爽 [2] 肖国强 [2] 邵艳卿 [2] 张炯明 [2] 方军 [2] 柴雪良 [1] 学术成果认领
作者单位 温州医科大学 检验医学院 生命科学学院,浙江 温州,325035 [1] 浙江省海洋水产养殖研究所, 浙江 温州 325005;浙江省近岸水域生物资源开发和保护重点实验室 浙江 温州 325001 [2]
分类号 Q789
栏目名称 研究论文
DOI 10.11759/hykx20150817001
发布时间 2016-03-23
基金项目
国家高技术研究发展计划 浙江省重大科技专项 浙江省科技计划项目 温州市种子种苗科技创新专项
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