椰子SSR反应体系的建立和优化
Optimization and Establishment of SSR Analysis Method in Coconut (Cocos nucifera L. )
摘要为摸索适宜椰子的SSR反应体系,分析了PCR反应体系中的Mg2+浓度、引物浓度、dNTP浓度、Taq DNA聚合酶浓度、模板浓度以及退火温度对扩增结果的影响,建立了适合椰子的SSR反应体系.研究结果表明:在20 μL反应体系中,Mg2+、引物和dNTP的最适浓度分别为2.5 mmol/L、0.3 μmol/L、0.2 mmol/L;Taq DNA聚合酶的最佳使用量为1 U,模板DNA应加入50 ng,引物最佳退火温度比Tm值较小者低2~3 ℃.在参数优化的基础上,应用标记分析该反应体系对24个海南不同地区高种椰子样品进行SSR分析,不同样品间DNA谱带多态性丰富,本研究建立的分析体系将为今后椰子资源的SSR分析奠定良好的研究基础.
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