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肠球菌菌种鉴定方法的探索

Exploration of methods for identification of Enterococcus

摘要目的 选择一种能将肠球菌属鉴定到种水平的快速准确的方法.方法 分别使用生化鉴定方法、16SrRNA基因测序技术、rpoA基因测序技术、基因组杂交技术(DNA-DNA hybridization,DDH)和平均核苷酸相似度(Average nucleotide identity,ANI)对12株肠球菌进行种水平鉴定,并比较生化鉴定方法、16S rRNA基因测序技术和rpoA基因测序技术和DDH/ANI结果的一致性.结果 经过DDH和ANI鉴定,分离自高原野生岩羊粪便的12株肠球菌中有5株屎肠球菌,4株海氏肠球菌,1株蒙氏肠球菌,1株鹑鸡肠球菌和1株疑似肠球菌属内新种,rpoA基因序列比对结果与DDH/ANI结果高度一致,生化鉴定和16S rRNA基因测序技术与DDH/ANI结果不完全相符.结论 rpoA基因序列比对可以方便快捷准确的将肠球菌鉴定到种水平.

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作者 白一波 [1] 徐明超 [2] 焦一帆 [2] 周娟 [2] 张思慧 [2] 杨晶 [2] 刘丽云 [2] 徐建国 [1] 学术成果认领
作者单位 山西医科大学公共卫生学院,山西太原030001;中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206 [1] 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,传染病预防控制国家重点实验室,北京102206 [2]
分类号 R211R446.5
栏目名称 技术与方法
DOI 10.3784/jbjc.202102210083
发布时间 2021-07-07
基金项目
国家重点研发计划项目
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疾病监测

疾病监测

2021年36卷5期

462-467页

ISTICPKUCSCDCA

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