换一批弥漫性大B细胞淋巴瘤的细胞起源亚型分类及预后
Cell-of-origin subtype classification and prognosis of diffuse large B-cell lymphoma based on variable importance analysis
摘要目的 基因表达谱(gene expression profiling,GEP)是弥漫性大B细胞淋巴瘤(diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL)细胞起源(cell-of-origin,COO)分类的金标准.本研究旨在建立一个基于GEP的简约模型来准确预测DLBCL的COO亚型并为其在临床上的应用提供参考.方法 收集GEO数据库中6个DLBCL数据集中的基因和临床数据,将其中1个数据集作为训练集,其余5个作为验证集.构建基于惩罚回归分析的变量重要性分析策略,识别最优变量子集,并通过logistic回归分析确定最终用于COO分类的六基因模型,采用生存分析评估训练集和验证集预测的两种COO亚型与临床预后的关系.结果 六基因模型在训练集预测效果较好[AUC(95％CI):0.999(0.997～1.000),判别斜率及其95％CI为0.944(0.920～0.966)],在验证集也表现出较好的效果[AUC及其95％CI波动范围从0.910(0.820～0.999)到1.000,判别斜率及其95％CI波动范围从0.506(0.350～0.966)到0.927(0.841～0.987)].预后模型显示,在训练集和验证集中6个基因预测的亚型均为风险预测因子(均P＜0.05).结论 六基因模型中的6个基因对DLBCL的分型和预后有重要的临床应用价值.基于变量重要性的基因排序为基因功能和靶向药物的进一步研究提供了参考依据.
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关键词
弥漫性大B细胞淋巴瘤惩罚回归预后亚型分类变量重要性分析Diffuse large B-cell lymphomaPenalized regressionPrognosisSubtype classifica-tionVariable importance analysis
栏目名称
DOI
10.16462/j.cnki.zhjbkz.2024.02.011
发布时间
2024-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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