换一批基于微生物组数据的成分中介分析方法模拟比较与应用
Simulation comparison and application study of compositional mediation analysis methods for microbiome data
摘要目的 系统评估因果成分中介模型(causal compositional mediation model,CCMM)、等距对数比变换的微生物组中介分析(isometric log-ratio transformation for microbiome mediation,IsometricLRTMM)和稀疏微生物组因果中介模型(sparse microbial causal mediation model,SparseMCMM)3种微生物组成分中介分析方法的性能,探索肠道菌属在克罗恩病不同治疗方式与治疗反应中的潜在中介作用.方法 通过模拟研究比较3种方法在不同样本量和中介变量维度下的效应估计精度和变量筛选能力,基于加拿大3所医院的儿童克罗恩病患者数据,分析治疗方式、肠道菌属与治疗反应间的关联.结果 模拟结果显示:在效应估计方面,各情形下CCMM均优于SparseMCMM,其总效应、直接效应及间接效应偏倚、方差、均方根误差均最小;中介变量筛选方面:IsometricLRTMM表现最佳,CCMM次之,SparseMCMM较弱.应用研究识别出5种与治疗反应相关菌属(粪球菌属、肠杆菌属、别样杆菌属、萨特氏菌属、柯林斯菌属),但均未发挥中介作用.结论 微生物组成分中介分析时,若侧重效应值估计推荐CCMM,若关注中介识别则IsometricLRTMM更优;本研究发现5种克罗恩病治疗反应相关菌属,为益生菌治疗靶点的筛选提供依据.
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DOI
10.16462/j.cnki.zhjbkz.2026.03.011
发布时间
2026-04-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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