换一批ASIP蛋白与AgRP相关蛋白生物信息比较分析
Bioinformatics Comparative Analysis of Agouti Signaling Protein and Agouti-Related Protein
摘要利用生物信息学的方法研究人、绵羊和牛等18个物种Agouti信号蛋白(ASIP)和Agouti相关蛋白(AgRP)的编码区及其对应氨基酸序列的相关特征,以期探明两种蛋白的遗传分化特点.结果表明,在ASIP与AgRP均为399bp的CDS序列中,其核苷酸保守区域的位置分别在262～399 bp和230～399 bp处;ASIP和AgRP在各自CDS序列多态位点变异的各项指标数值及其百分率大小上均极为接近;在46条ASIP的CDS序列及32条AgRP的CDS序列中,二者的单倍型数分别为22种和23种,ASIP和AgRP在基因的进化以及不同物种的遗传分化上具有相似性;两者的氨基酸序列在98～140 aa片段处保守性较高,该区域同时富含半胱氨酸(Cys);ASIP和AgRP一级结构的理化性质表现为共性与差异并存;二者的肽链C端具有相似的三维结构,但各自也具有其结构特异性.
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分类号
S811.6
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DOI
10.3969/j.issn.1673-1182.2014.01.003
发布时间
2014-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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