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    首页 > 基础医学与临床 > 目标序列二级结构对RNA干扰效果的影响

    目标序列二级结构对RNA干扰效果的影响

    Secondary structure of target RNA impacts on RNA interference efficiency

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    摘要目的探讨RNA二级结构对RNA干扰效果的影响,为RNA干扰靶序列的选择及设计有效siRNA提供依据.方法以K562细胞为模型,N-RAS基因mRNA为模板,分别针对二级结构茎区及二级结构环区设计4对siRNA,并分别采用RT-PCR、细胞活力检测及流式细胞检测等方法在RNA及细胞水平检测干扰效果差异.结果干扰结果表明,针对目标序列的siRNA均能对同源基因的表达产生一定程度的抑制,而针对二级结构环区目标序列的siRNA干扰效果明显优于针对二级结构茎区的siRNA.结论RNA干扰效果与目标序列二级结构密切相关,在进行RNA干扰实验的目标序列选择时,应考虑二级结构的因素.

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    作者 燕翔 [1] 马文丽 [2] 宋艳斌 [2] 张宝 [2] 郑文岭 [3] 学术成果认领
    作者单位 解放军总医院,肿瘤内科,北京,100853;南方医科大学,分子生物学研究所,广东,广州,510515 [1] 南方医科大学,分子生物学研究所,广东,广州,510515 [2] 华南基因组研究中心,广东,广州,510800 [3]
    关键词 siRNAN-RAS基因K562细胞二级结构
    主题词 细胞(Cells)基因(Genes)方法(Methods)目的(Goals)
    分类号 Q78
    栏目名称 研究论文
    DOI 10.3969/j.issn.1001-6325.2006.06.003
    发布时间 2006-07-07
    基金项目
    国家自然科学基金
    • 浏览274
    • 被引6
    • 下载4
    基础医学与临床

    基础医学与临床

    2006年26卷6期

    570-574页

    ISTICCA

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