换一批
换一批肾脏纤维化大鼠模型尿液中差异表达基因筛选及生物信息学分析
Differentially expressed gene screening of urinesamples from rats renal fibrosis model and bioinformatics analysis
摘要目的研究大鼠肾脏纤维化(RF)模型尿液中差异表达的基因,并对其进行生物信息学分析.方法将大鼠分为对照组和纤维化模型组,单侧输尿管结扎术建立大鼠肾脏纤维化模型,收集尿液.提取总RNA,构建测序文库并进行转录组测序.对差异表达的mRNA进行了GO分析和KEGG分析,并对miRNA的前体和lncRNA的家族进行预测和分类.结果肾脏纤维化模型组的尿液和对照组相比,得到813条表达上调转录本数据以及213条表达下调的转录本数据.结论利用转录组高通量测序结合相关生物信息学分析,可为肾脏纤维化诊断靶点提供新的可能.
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关键词
肾脏纤维化生物信息学分析转录组测序单侧输尿管结扎renal fibrosisbioinformatics analysistranscriptome sequencingunilateral ureteric obstruction
分类号
R34
栏目名称
研究论文
DOI
10.3969/j.issn.1001-6325.2017.04.015
发布时间
2017-05-08
基金项目
国家重点基础研究发展计划
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