换一批糖尿病合并TREM2突变相关认知功能障碍的生物信息学分析
Bioinformatics analysis of cognitive dysfunction associated with diabetes mellitus with TREM2 mutation
摘要目的 通过生物信息学分析探寻糖尿病(DM)合并髓系细胞触发受体-2(TREM2)突变相关认知功能障碍的核心基因及可能的治疗靶点.方法 利用微阵列数据分析,分别得到糖尿病合并TREM2突变相关认知功能障碍2个疾病的差异基因并交集得到共同的差异基因.对其进行GO分析、KEGG和Reactome通路分析,利用在线数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI);最后利用水迷宫检测糖尿病和TREM2对小鼠空间学习记忆能力的影响;利用蛋白质免疫印迹检测SNAP25表达的变化.结果 在这2个数据集中,有19个基因变化相同,这些基因主要在与神经元和代谢相关的生物过程和通路富集.根据PPI分析结果,确定DNER、GFAP、GRM5、SNAP25为核心基因.Trem2敲除加重糖尿病模型小鼠空间学习记忆障碍,糖尿病小鼠海马SNAP25表达明显增加,Trem2敲除后SNAP25表达显著降低.结论 本研究发现19个糖尿病合并认知功能障碍中TREM2相关基因,得到4个核心基因.这些结果为治疗糖尿病合并认知功能障碍患者提供新的实验依据.
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关键词
糖尿病认知功能障碍髓系细胞触发受体-2(TREM2)生物信息学diabetes mellituscognitive dysfunctiontriggering receptor expressed on myeloid cells-2(TREM2)bioinformatics
栏目名称
DOI
10.16352/j.issn.1001-6325.2024.05.0630
发布时间
2024-05-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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