换一批基于计算机辅助药物设计筛选中药单体中的法尼醇受体抑制剂
Screening for FXR Inhibitors in Traditional Chinese Medicine Monomers Based on Computer Technology
摘要目的 利用计算机辅助药物设计技术挖掘拮抗细胞毒性胆汁酸的中药单体成分抑制剂.方法 使用三维定量构效关系(3D-QSAR)学习 34 个已有的法尼醇受体(FXR)抑制剂的药效团特征,建立机器预测模型,搭配药代动力学预测(ADMET)来虚拟筛选 13 144 个中药单体,得到候选化合物.随后,以分子对接和分子动力学模拟为方法,模拟候选化合物、FXR激动剂鹅去氧胆酸(CDCA)、FXR抑制剂(Z)-Gugglesterone对FXR配体结构域的竞争性结合,以及对转录复合物结构稳定性的影响.结果 2 436 个中药单体通过了机器预测筛选,具备FXR抑制剂药效团特征;随后选取IC50 预测值位于前 300 名(IC50<0.286 nM)的单体进行ADMET预测,最终苦参啶被虚拟筛选为候选化合物,ADMET结果表明,苦参啶具有良好的类药性、口服吸收能力和低毒性.分子对接和动力学模拟结果显示,苦参啶能以更强力的方式和CDCA、(Z)-Gugglesterone竞争FXR的相同结合位点,强力减弱FXR和共激活因子之间的结合.结论 苦参啶有潜力成为强效FXR抑制剂的先导化合物,该研究结合了基于配体和结构的计算机辅助药物设计,为进一步的实验验证提供理论依据.
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分类号
R285.5（中药学）
栏目名称
DOI
10.13728/j.1673-6427.2025.04.006
发布时间
2025-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
内蒙古自治区卫生健康委员会公立医院科研联合基金科技项目（2024GLLH1364）
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