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SRSF6在大鼠胰岛细胞中结合的靶标及测序分析

Target and sequencing analysis of SRSF6 binding in rat islet cells

摘要目的 研究富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子6(serine and arginine rich splicing factor 6,SRSF6,又称SRp55)作为RNA剪切因子在大鼠胰腺β细胞中对胰岛素分泌影响的具体机制.方法 通过改进的RNA结合蛋白免疫共沉淀高通量测序(improved RNA Binding Protein Immunoprecipitation highthroughput sequencing,iRIP-seq)技术在大鼠胰岛细胞中鉴定SRSF6调控的基因及功能通路,对SRSF6直接作用的靶标和调控通路及可变剪接事件进行鉴定.结果 SRSF6富集性地结合编码区和内含子区域,KEGG分析发现SRSF6结合的靶标在胰岛素信号通路显著富集.结论 SRSF6可能通过与胰岛素通路相关重要基因的mRNA前体结合,调控它们的剪接和加工,进而成为影响胰岛素分泌的潜在因素.

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