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炭疽芽孢杆菌芽孢适配子的结构与亲和性分析

STRUCTURES AND AFFINITY ANALYSIS OF APTAMERS TO BACILLUS ANTHRACIS SPORES

摘要为了对炭疽芽孢杆菌疫苗株A.16R芽孢的适配子进行亲和性分析,体外构建了78个碱基的随机DNA库,以炭疽芽孢杆菌疫苗株A.16R芽孢为靶标,用SELEX技术进行了15轮的筛选,将筛选到的适配子库进行克隆、测序,用Macaw 2.05和DNA sis v2.5软件对每一适配子的保守序列和二级结构进行分析,并用生物素-链酶亲和素-辣根酶系统检测,根据OD值的高低判定亲和力的大小,对每一适配子进行亲和力测定。结果表明,适配子的亲和力高低不一,OD值最高为1.2,最低为0.25,二级结构分析结果显示,茎环和茎等二级结构可能是适配子与芽孢结合的基础;其一级结构提示有AGGGG、CCCCG、GGGTT、ACACT等保守序列,上述分类与OD值的高低分布基本吻合。

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解放军医学杂志

解放军医学杂志

2001年26卷6期

419-422页

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