SARS冠状病毒的多组织嗜性及其全基因序列的测定
Analysis of multiple-tissue tropism and gene sequence of SARS-associated coronavirus
摘要目的研究SARS冠状病毒对不同组织的感染情况,了解SARS流行初期病毒的基因组序列.方法用Trizol RNA抽提试剂提取因SARS病毒感染而死亡的3例死者不同组织中的总RNA,并逆转录为cDNA,然后用针对SARS病毒不同基因区间的引物进行PCR扩增,并对其中1例肺组织中病毒全序列进行了测定.结果 3例病例中有2例仅在肺组织中扩增到病毒序列,另1例除在肺组织中检测到病毒外,还在气管、肾、淋巴结及肝组织中检测到病毒的存在.病毒全序列分析结果显示,该序列全长为29 760个碱基,具有典型的冠状病毒序列特征,除具有RNA聚合酶基因和S、E、M和N 4种结构蛋白基因外,还有另外8个蛋白编码框.经与GenBank上登录的部分其他SARS冠状病毒全序列进行比对,发现该序列除存在少量的SNP外,还多出一段29个核苷酸的序列,这段序列的存在完全改变了ORF10和ORF11两个蛋白编码框,使得在此终止的蛋白翻译能够继续进行下去,从而使ORF10和ORF11两个读框成为一个读框.结论 SARS病毒具有多组织嗜性;该序列有可能是病毒从动物传到人的原始序列.
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