换一批BCESCP：基于多类支持向量机的B细胞表位亚类分类研究
BCESCP:Discrimination and Prediction of Subclasses of B-cell Epitopes Using Multi-class Support Vector Machine
摘要目的：根据诱导的特异性抗体种型，B 细胞表位被分成不同的亚类。探索表位多类亚类之间的区别非常重要，能促进揭示免疫系统为什么会针对不同的表位产生特异性抗体应答。基于多类支持向量机，发展一个能区分多类表位亚类并且能预测 B 细胞表位的亚类类别的模型。方法：训练模型的数据集来源于免疫表位数据库，数据集包含4类数据，对应4种 B 细胞表位亚类：IgA 表位，IgE 表位，IgG 表位以及 IgM表位。通过5折交叉验证，分别探索氨基酸组成特征，quasi-序列顺序特征以及二肽组成特征区分表位多类亚类的能力。结果：实验结果表明二肽组成特征的区分性能最好，整体准确率为61．58％，应用此多类分类模型，开发了一个名为BCESCP 的免费使用的 B 细胞表位的亚类类别预测服务器，BCESCP 可以通过如下地址访问：http：／／www．bioin-fo．tsinghua．edu．cn ／epitope ／BCESCP／。
更多相关知识
分类号
R392.1（医学免疫学）
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1007-7146.2015.05.010
发布时间
2015-11-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
973 Program （(2009CB918801)）
- 浏览320
- 被引0
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
