比较DNA微阵列芯片和微生物质谱在非结核分枝杆菌鉴定中的应用
Comparing the application of DNA microarray chip and MALDI-TOF mass spectrometry in the identification of non-tuberculous Mycobacterium species
摘要目的 比较DNA微阵列芯片和微生物质谱在非结核分枝杆菌(nontuberculous mycobacteria,NTM)鉴定中的准确性和优缺点,为临床诊断NTM感染提供参考.方法 收集2022年7月至2024年10月期间江西省人民医院住院和门诊病人中临床怀疑NTM感染的病人样本.每份样本分成两份,一份进行酸性罗氏固体培养基培养,一份进行分枝杆菌DNA微阵列芯片检测.样本最长培养8周,长出明显菌落后,挑取菌落分别进行DNA微阵列芯片检测、微生物质谱检测和16srRNA全序列测序.结果 最终通过16s rRNA全序列测序鉴定出NTM感染的临床样本共32例.以测序结果作为检测金标准,样本直接进行DNA微阵列芯片检测的准确性为90.6%;经过分离培养后,菌落DNA微阵列芯片的准确性为100%,质谱鉴定的准确性为96.9%.结论 样本培养后,DNA微阵列芯片对NTM鉴定的准确性优于质谱法,但质谱法的检测成本远比DNA微阵列芯片低.DNA微阵列芯片可对临床样本直接进行检测,且准确性>90%,从样本送检到结果报告只要8 h,可以满足临床对快速诊断的迫切要求.
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