摘要目的:探讨hsa-miR-421 的靶基因预测与相关生物信息学在肿瘤疾病中的生物学功能、信号传导通路及其所发挥的分子调控机制.方法:利用在线数据库分析hsa-miR-421 的碱基序列、基因位点及序列保守性,研究其在人体不同疾病中的表达情况,并预测 hsa-miR-421 的靶向调控基因.随后进行GO功能注释分析、KEGG通路富集分析,并构建蛋白互作(PPI)网络及关键(hub)基因筛选.结果:hsa-miR-421 成熟序列在多物种间高度保守.获得的 508 个靶基因存在于RNA 聚合酶Ⅱ启动子转录的调控、DNA 模板转录的调控、蛋白质结合等分子功能,并富集于糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、神经营养因子信号通路、泛素介导的蛋白水解等信号通路.基于hsa-miR-421 靶基因集合的PPI网络构建与度中心性(Degree Centrality)值筛选出排名前十位的 hub 基因(SRSF1、HNRNPA2B1、HNRNPA1、TRAF6、SMAD2、MAPK14、CDC42、MAPK9、PRKACB、NRAS).结论:hsa-miR-421 通过调控靶基因广泛参与到人类生命活动和疾病发生发展等过程.
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