换一批人参皂苷生物合成相关基因PgRg2BBE克隆及生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis of PgRg2BBE Gene in Panax gin-seng Rg2 Biosynthesis
摘要克隆与人参皂苷Rg2合成相关的重要酶基因PgRg2BBE全长cDNA序列,并利用在线软件对该基因编码的蛋白质进行理化性质、结构域、亚细胞定位和系统进化等分析.结果表明:PgRg2BBE基因cDNA序列长为1 638 bp,编码545个氨基酸.PgRg2BBE蛋白分子量为60 967.10u,等电点为8.88,不稳定性指数为34.04,预测该蛋白为一种稳定的亲水性跨膜蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲组成.PgRg2BBE蛋白含有FAD_binding_4和BBE功能结构域,定位于叶绿体中,含有24个氨基酸序列信号肽.系统发育树分析发现,其与智利茄的亲缘关系最近,氨基酸序列多重比对发现,RgRg2BBE中含有4个保守基序,进一步与拟南芥At-BBE家族蛋白进行同源序列比对,发现它们同时具有4个保守基序(RKYGL、MGED、FWAIRGG、FPEI).
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关键词
人参皂苷Rg2生物合成PgRg2BBE基因克隆生物信息学序列分析ginsenoside Rg2biosynthesisPgRg2BBEgene cloningbioinformaticssequence analysis
栏目名称
DOI
10.13327/j.jjlau.2022.1613
发布时间
2024-01-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
吉林省科技发展计划项目（20180101027JC）
吉林省科技发展计划项目（20200403011SF）
吉林省科技发展计划项目（20210204063YY）
吉林省教育厅十三五科学技术项目（JJKH20170310KJ）
国家自然科学基金（31401445）
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