换一批
换一批克隆与序列分析中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)HSP70基因全长ORF的RACE
RACE clone and sequence analysis of Hsp70 gene ORF of Eriocheir sinensis
摘要采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)及cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆中华绒螯蟹(Edocheirsinensis)的Hsp70基因并进行序列分析.以中华绒螯蟹卵组织cDNA为模板,克隆测序后拼接得到一条长2 429 bp的cDNA序列,序列分析表明其覆盖了完整编码区,编码649个氨基酸.经antheprot分析发现2个Hsp70基因的签名序列:IFDLGGGTFDVSIL,IVLVGGSTRIPKIQK;Dnak特征基序DLGTF-S-V;非细胞器基序:RARFEEL;核定位信号标签:KKDPSESKRALRRL;胞质Hsp70特征基序GPTIEEVD.经BLASTn和BLASTx软件分析,该编码区核苷酸序列与凡纳滨对虾(Litopenaeus uannamei)、斑节对虾(Penaeus monodon)的相似性分别为85.30%和84.89%.根据核苷酸序列所推导出的Hsp70氨基酸序列,其与斑节对虾、罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)的相似性分别为93.23%和93.40%.本研究克隆了中华绒螯蟹的Hsp70基因,为进一步深入研究锯缘青蟹的抗逆机理及其遗传改良奠定了基础.
更多相关知识
主题词
基因(Genes)序列分析(Sequence Analysis)逆转录聚合酶链反应(Reverse Transcriptase Polymerase Chain Reaction)对虾科(Penaeidae)碱基序列(Base Sequence)
分类号
Q915.819+.6
DOI
10.3969/j.issn.1000-9965.2008.05.021
发布时间
2009-02-18
基金项目
国家自然科学基金
- 浏览168
- 被引7
- 下载0
相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文
