换一批人外周血细胞放射损伤相关基因的生物信息学
Bioinformatic analysis of gene expression of human peripheral blood cells related to radiation injury
摘要目的 从基因水平揭示放射前后人外周血细胞的变化.方法 从基因表达数据库(GEO)中下载两组经放射处理后人外周血基因芯片数据,利用Qlucore Omics Explorer 3.0软件筛选差异表达基因,STRING、DAVID等在线分析工具对差异表达基因进行下一步的生物信息学分析.结果 共筛选出94个共同差异表达基因,其中共同表达上调31个,共同表达下调11个,这些差异表达基因主要涉及到细胞凋亡的调控,细胞程序性死亡的调控,细胞死亡的调控,细胞周期的调控,DNA损伤应答,胞内信号转导等的分子功能及生物学过程.通过STRING分析,发现泛素C(UBC)、增殖细胞核抗原(PCNA)、鼠双微体基因-2(MDM2)处在核心节点位置,并参与p53通路.结论 通过生物信息学的方法分析得出UBC、PCNA、MDM2可能成为潜在的防护放射后损伤的靶点.
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关键词
放射损伤基因芯片生物信息学差异表达基因数据分析人Radiation injuryGene microarrayBioinformaticsDifferentially expressed genesData analysisHuman
分类号
R818.74（放射医学）
栏目名称
DOI
10.16098/j.issn.0529-1356.2017.01.007
发布时间
2017-03-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家自然科学基金（81502761）
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