换一批
换一批基于4D-Label-free技术慢性弥漫性轴索损伤大鼠海马组织的蛋白质组学分析
Proteomic analysis of hippocampal tissue in rats with chronic diffuse axonal injury based on 4D-Label-free technique
摘要目的 筛选慢性弥漫性轴索损伤(DAI)大鼠海马组织差异表达蛋白(DEPs),为探索慢性DAI潜在发病机制以及临床诊断、筛选药物治疗靶点、评估预后等提供实验依据.方法 实验动物分为模型组(DAI组,n=20)和对照组(CON组,n=20),采用改良的Marmarou法建立SD大鼠DAI模型,模型建立3周后利用4D-Label-free技术检测慢性DAI组脑海马组织中的蛋白图谱变化,以DAI组/CON组表达量变化倍数(FC)＞1.2或＜0.83且P＜0.05筛选DEPs,运用基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析方法对筛选的DEPs进行生物信息学分析.结果 共筛选出92个DEPs,上调52个,下调40个.GO分析结果显示,DEPs主要涉及去磷酸化,ATP合成耦合电子传递,过氧化氢介导的细胞程序性死亡的正向调节及神经递质受体内化等生物过程功能.KEGG通路分析结果提示,DEPs主要参与代谢途径、活性氧、神经变性途径-多种疾病、逆行内源性大麻素信号传导、谷胱甘肽代谢等信号通路.结论 通过4D-Label-free技术筛选出了慢性DAI组大鼠海马组织中的DEPs.所筛选出的DEPs及其所富集的生物过程和信号通路为慢性DAI的深入研究提供依据.
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关键词
弥漫性轴索损伤蛋白质组学4D-Label-free技术生物信息学分析大鼠Diffuse axonal injuryProteomics4D-Label-free techniqueBioinformatics analysisRat
分类号
R651.1+5
栏目名称
DOI
10.16098/j.issn.0529-1356.2024.05.001
发布时间
2024-10-21
基金项目
重庆市自然科学基金（cstc2019jcyj-msxmX0455）；
重庆医药高等专科学校创新研究群体建议项目（YGZ2019402）；
重庆医药高等专科学校校级自科重点项目（ygz2020102）；
重庆医药高等专科学校校级自科重点项目（ygz2021119）；
重庆市科卫联合医学科研项目（2023MSXM074）；
重庆市自然科学基金博士后项目（CSTB2023NSCQ-BHX0052）；
重庆市教委科学技术研究项目（KJ0N202315134）
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