基于网络药理学与生物信息学探究华蟾酥毒基治疗胃癌的作用机制

Investigating mechanism of cinobufagin in gastric cancer treatment based on network pharmacology and bioinformatics

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摘要目的基于网络药理学结合生物信息学、分子对接技术,探究华蟾酥毒基(cinobufagin,CBG)治疗胃癌的作用机制.方法利用PubChem数据库、TCMSP数据库和SwissTargetPrediction数据库,收集CBG治疗胃癌活性成分的结构及其潜在靶点.从TGGA数据库获取胃癌样本转录组数据,通过差异基因分析获取胃癌相关靶点.取CBG靶点和胃癌疾病靶点的交集,进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析.使用STRING数据库对共同靶点构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape软件筛选核心靶点,SYBYL-X 2.1.1软件将筛选得到的核心靶点和CBG进行分子对接,进一步筛选出得分排名前10的靶点,利用Kaplan-Meier plotter数据库筛选出与胃癌患者生存期密切相关的靶点.结果 CBG治疗胃癌涉及59个靶点,关键核心靶点19个,其中关键靶点极光激酶A(AURKA)、肝细胞生长因子受体细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、增强子同源物2(EZH2)、肝细胞生长因子受体(MET)、基质金属蛋白酶3(MMP-3)、孕酮受体(PGR)、前列腺素内过氧化物合酶1(PTGS1)和胸苷酸合成酶(TYMS)与CBG具有较好的结合活性,且与胃癌预后密切相关.结论 CBG可能通过多靶点、多途径来发挥抗胃癌作用.