换一批插入缺失位点和miniSTR在甲醛固定石蜡包埋组织中的应用检测
Application detection of insertion/deletion locus and miniSTR in formalin fixed paraffin embedded tissue
摘要目的:研究插入缺失位点InDel与mini短串联重复序列(STR)遗传标记对甲醛固定石蜡包埋组织应用的价值.方法:19份甲醛固定石蜡包埋组织作为疑难检材,应用3种常染色体遗传标记多重扩增系统,即InDel系统(Investigatior? DIPplex Kit)、miniSTR系统(华夏白金扩增试剂盒)和STR系统(Goldeneye? 20A),对STR分型不完整或失败的检材,再分别用InDel和miniSTR系统进行DNA分型检测,比较两者的分型质量和检出率.结果:19份甲醛固定石蜡包埋组织经Goldeneye 20A试剂盒检测,均分型不完整.应用miniSTR系统检测显示,7份样本的检出率100%,其中,D19S433基因座的检出率为100%,D5S818、D13S817和D1S1656基因座的检出率最小,为36.84%.应用InDel系统检测发现,1份样本InDel位点电泳分型完整,所有样本的位点丢失率均小于50%,其中7份样本的位点丢失率低至10%以下.结论:应用遗传标记对甲醛固定石蜡包埋组织这类疑难降解检材进行检测,插入缺失多态性位点InDel与miniSTR可以作为联合检测标记.
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关键词
插入/缺失多态性位点短串联重复序列甲醛固定石蜡包埋降解检材insertion/deletionshort tandem repeatformalin-fixed and paraffin-embedded tissuedegraded sample
栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1001-1633.2023.04.008
发布时间
2023-10-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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