中华按蚊miRNAs的全基因组鉴定和分类

WHOLE-GENOME IDENTIFICATION AND CLASSIFICATION OF THE MIRNAS IN THE MALARIA VECTOR ANOPHELES SINENSIS ( DIPTERA: CULICIDAE)

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摘要小分子RNA (miRNA) 是一类小的非编码RNA, 在细胞凋亡、分化和先天性免疫等生物学过程中发挥着重要作用.中华按蚊是中国和东南亚国家分布最广的疟疾传播媒介, 本研究采用生物信息学方法注释了中华按蚊基因组的小分子RNA, 测序和鉴定了7个样本的小分子RNA.这7个样本来自实验室拟除虫菊酯感性品系、 3个野外拟除虫菊酯抗性群体和3个野外拟除虫菊酯感性群体.基于基因组序列共鉴定出272个miRNA, 总长为24 978 bp, 占基因组的0.009%.从这7个样本的测序和注释中, 共鉴定出62个已知的miRNA和432个新的miRNA.这些样本间已知miRNA的数量没有明显的差异, 说明这些已知的miRNA非常普通的, 表达量最高.在实验室和野外样品之间以及除虫菊酯抗性和感性样品之间, 新miRNA的数量没有明显的差异.本研究提供了中华按蚊miRNA的信息框架, 然而, 还需要进一步的研究来揭示这些样品中miRNA种类之间的关系, 以及这些miRNA在不同样品中对拟除虫菊酯抗性的调控机制.

作者陈斌 ^[1] Sana ASGHAR ^[1] Bin CHEN ^[2] 学术成果认领

作者单位重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所, 媒介昆虫重庆市重点实验室,动物生物学重庆市重点实验室, 重庆401331 ^[1] Chongqing Key Laboratory of Vector Insects, Chongqing Key Laboratory of Animal Biology, Institute of Entomology and Molecular Biology, Chongqing Normal University, Chongqing 401331, China ^[2]

关键词中华按蚊 miRNA 鉴定分类拟除虫菊酯抗性 Anopheles sinensis miRNA Identification Classification Pyrethroid resistance

主题词基因组(Genome)研究(Research)野外(Wilderness)实验室(Laboratories)细胞凋亡(Apoptosis)

栏目名称著述

DOI 10.3969/j.issn.1005-0507.2019.02.002

发布时间 2019-09-05

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基金项目: 国家自然科学基金项目 国家科技基础性工作专项重点项目 国际原子能机构CRP项目