换一批中华按蚊miRNAs的全基因组鉴定和分类
WHOLE-GENOME IDENTIFICATION AND CLASSIFICATION OF THE MIRNAS IN THE MALARIA VECTOR ANOPHELES SINENSIS ( DIPTERA: CULICIDAE)
摘要小分子RNA (miRNA) 是一类小的非编码RNA, 在细胞凋亡、分化和先天性免疫等生物学过程中发挥着重要作用.中华按蚊是中国和东南亚国家分布最广的疟疾传播媒介, 本研究采用生物信息学方法注释了中华按蚊基因组的小分子RNA, 测序和鉴定了7个样本的小分子RNA.这7个样本来自实验室拟除虫菊酯感性品系、 3个野外拟除虫菊酯抗性群体和3个野外拟除虫菊酯感性群体.基于基因组序列共鉴定出272个miRNA, 总长为24 978 bp, 占基因组的0.009%.从这7个样本的测序和注释中, 共鉴定出62个已知的miRNA和432个新的miRNA.这些样本间已知miRNA的数量没有明显的差异, 说明这些已知的miRNA非常普通的, 表达量最高.在实验室和野外样品之间以及除虫菊酯抗性和感性样品之间, 新miRNA的数量没有明显的差异.本研究提供了中华按蚊miRNA的信息框架, 然而, 还需要进一步的研究来揭示这些样品中miRNA种类之间的关系, 以及这些miRNA在不同样品中对拟除虫菊酯抗性的调控机制.
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DOI
10.3969/j.issn.1005-0507.2019.02.002
发布时间
2019-09-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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