甘肃武威地区蜱类携带潜在新病毒的宏转录组研究
META-TRANSCRIPTOMIC DISCOVERY FOR EMERGING TICK-BORNE VIRUSES IN WUWEI,GANSU PROVINCE
摘要目的 监测甘肃省蜱类自然携带病毒状况,明确丝绸之路经济带蜱媒病毒病传播风险.方法 选择甘肃省黄土高原、青藏高原和蒙新高原交汇的武威地区为样点,采集游离及寄生蜱样本,经形态鉴定后利用宏转录组测序技术获得病毒组数据,进而组装病毒序列并进行注释.依据序列系统发育分析探索蜱类自然携带病毒的多样性,发现潜在新病毒.结果 共获得武威地区蜱类3属5种98只,包括森林革蜱Dermacentor silvarum、亚洲璃眼蜱 Hyalomma asiaticus、草原革蜱 D.nuttalli、盾糙璃眼蜱 Hy.scupense 和柯洛宁血蜱Haemaphysalis kolonini.从中获得丰度最高的为楚病毒科(Chuviridae)的芈病毒属 Mivirus;内罗病毒科(Nairoviridae)正内罗病毒属Orthonairovirus和痘病毒科(Poxviridae)正痘病毒属Orthopoxvirus次之.组装后序列比对为博乐蜱病毒1(Bole tick virus 1)、博乐蜱病毒3(Bole tick virus 3)、昌平蜱病毒1(Changping tick virus 1)、泰顺蜱病毒(Taishun tick virus)序列.同时,发现一种新的黄病毒科(Flaviviridae)病毒成员,与最接近的未定种黄病毒相似度为96.92%,暂命名为"类博乐蜱病毒4(Bole-like tick virus 4)",有待进一步分离和鉴定.结论 甘肃省蜱类携带多种蜱媒病毒,可能存在新病毒,应持续、有效地开展监测和预防工作.
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