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宁夏拉乌尔立克次体的分离鉴定及基因组特征分析

ISOLATION,IDENTIFICATION,AND GENOMIC CHARACTERIZATION OF RICKETTSIA RAOULTII FROM NINGXIA TICKS

摘要目的 斑点热群立克次体(spotted fever group rickettsiae,SFGR)是一种全球分布的专性细胞内细菌,能够引起严重甚至致命的疾病,本文旨在研究中国西北部宁夏地区的SFGR物种和遗传特征.方法 在宁夏地区收集蜱样本,鉴定后用于 SFGR 的分离.通过形态学观察、多位点序列分型(Multi-locus sequence typing,MLST)及系统发育分析对分离的菌株进行鉴定.分离的菌株被鉴定为拉乌尔立克次体Rickettsia raoultii,并采用下一代测序技术进行了全基因组测序.结果 本研究成功分离出一株立克次体,命名为Rickettsia raoultii strainTIGMIC.TIGMIC菌株能够在哺乳动物细胞中稳定生长.该菌株的完整基因组序列被组装成 1 条长度为 1 312 176 bp的环状染色体,包含 1 488 个基因.功能注释显示,TIGMIC菌株的主要关键基因主要与生物合成、营养代谢和细胞膜生物发生相关.除了rickA基因外,TIGMIC菌株中大多数典型立克次体毒力基因相对保守.结论 宁夏地区存在拉乌尔立克次体,这一发现表明该地区存在斑点热的自然疫源地,因此,强调了加强对SFGR传播的监测和预防工作的必要性.

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