换一批
换一批摘要聚类分析是从基因表达数据中提取生物医学信息的主要方法.针对基本粒子群优化算法易陷入局部极值和对可调参数敏感的问题,提出了一种新型粒子对算法来解决基因聚类问题.算法初始化四个粒子,随机分成两对,将K-均值快速聚类的结果作为每个粒子对中一个粒子的初始位置.在每次迭代中,粒子仅依靠自身速度和粒子对的最佳位置来完成自身更新.每个粒子对产生的精英粒子,组成一个新的粒子对,继续搜索,新粒子对的最优位置即为聚类算法的最优解.实验结果表明算法具有良好的同质性和差异性,且在计算时间和收敛速度方面具有相当的优势.
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关键词
基因表达谱粒子群优化粒子对聚类分析gene expression profileparticle swarm optimizationparticle pairclustering analysis
分类号
TP391
栏目名称
工程与应用
DOI
10.3778/j.issn.1002-8331.2009.36.061
发布时间
2010-03-02
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