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基于Transformer的促炎肽预测

Prediction of Pro-Inflammatory Peptides Based on Transformer

摘要提出了一种基于改进Transformer架构的深度学习模型,用于预测促炎肽,以解决传统实验方法周期长及特征表征不足的问题.模型通过整合多维度3-mer特征编码,构建改进的Transformer深度学习框架,基于去冗余数据集的五折交叉验证表明,改进模型在关键性能指标上显著优于基准方法MultiFeatVotPIP:准确率(ACC)提升11.4%至76.9%,曲线下面积(AUC)提高12.2%至80.8%.特征分析验证了3-mer特征在捕捉局部残基模式和跨域相互作用中的优势,为高通量促炎肽筛选和炎症疾病机制研究提供了新工具和新思路.

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DOI 10.16644/j.cnki.cn33-1094/tp.2025.04.003
发布时间 2025-04-29(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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