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DNA双序列比对问题的算法

DNA Pairwise Sequence

摘要随着生物序列数据库中序列数据的激增,开发兼有高度生物敏感性和高效率的算法显得极为迫切。通过对生物序列比对问题中Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法深入分析,提出了Smith-Waterman算法的改进算法,并通过实验验证该算法,对改进前后的运行性能进行比较分析。实验证明,改进后的算法实现了双序列局部最优解个数的优化,有效降低了生物序列比对算法时间与空间的复杂性,提高序列比对的得分率和准确率。

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DOI 10.3969/j.issn.1003-3254.2015.09.019
发布时间 2015-09-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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