基于骨架结构分类法的递进式药物筛选
Progressive screening using scaffold-based classification approach
摘要本文报告一种新颖的基于骨架结构分类法的递进式药物筛选(PS-SCA)技术.此技术在美国国立癌症研究所(NCI)的八组细胞水平上的高通量筛选实验数据上进行了测试,结果表明,基于拓扑结构数据的递进式筛选可以极大地降低药物筛选的代价,缩短筛选时间.模拟实验证明,PS-SCA递进式筛选技术包括三个阶段:(1)骨架多样性采样筛选试验:(2)活性化合物发现试验:(3)可忽略的多余筛选试验.运用PS-SCA递进式筛选技术,可以在只筛选20%的化合物情况下找到最有意义的70-80%的活性化合物.而且,这70%-80%的活性化合物中包含了关键的结构骨架.
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作者单位
美国DPI制药公司.9640,Towne,Centre,Drive,San,Diego,CA,92121,USA;中南大学化学化工学院中药现代化研究中心,湖南省长沙市庐山路,410083
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中南大学化学化工学院中药现代化研究中心,湖南省长沙市庐山路,410083
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栏目名称
一、算法研究
DOI
10.3969/j.issn.1001-4160.2007.01.004
发布时间
2007-04-25
基金项目
国家自然科学基金
the cultivation fund of the key Scientific
Technical Innovation Project, Ministry of Education of China
计算机与应用化学