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    首页 > 江苏农业科学 > HIV-1整合酶四聚体的模建及结构基础研究

    HIV-1整合酶四聚体的模建及结构基础研究

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    摘要HIV-1整合酶(HIV-1 IN)是目前开发抗艾滋病药中最具潜力的药物靶点之一,四聚体是该蛋白发挥生物学功能的主要聚集体形式.为了得到IN四聚体与病毒DNA的复合物,并研究其运动性与生物学功能的关系,采用同源模建、结构优化及叠落等方法,在Tn5转座酶的基础上建立了IN-DNA的复合物模型,并采用高斯网络模型和各向异性网络模型研究四聚体的运动模式.Ramachandran Plot分布和Profile-3D结果验证了复合物模型的合理性.运动模式结果表明,四聚体的N-端、C-端的运动有利于螯合DNA,而核心区的稳定状态是IN发挥整合作用的前提.分子对接结果表明,IN抑制剂更偏向于结合在四聚体中间CCD与病毒DNA结合的区域.

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    作者 左柯 [1] 胡建平 [2] 杜文义 [1] 梁立 [1] 刘嵬 [1] 苟小军 [1] 学术成果认领
    作者单位 药食同源植物资源开发四川省高校重点实验室/四川抗菌素工业研究所/成都大学,四川成都,610106 [1] 药食同源植物资源开发四川省高校重点实验室/四川抗菌素工业研究所/成都大学,四川成都610106;乐山师范学院化学学院,四川乐山614004 [2]
    关键词 HIV-1整合酶四聚体病毒DNA高斯网络模型各向异性网络模型分子对接
    分类号 R918-39
    栏目名称
    生物技术
    DOI 10.15889/j.issn.1002-1302.2017.22.008
    发布时间 2018-01-09
    基金项目
    国家自然科学基金（11247018、11147175）； 四川省教育厅科研重点项目（12ZA066）； 乐山市科技计划（14SZD018）
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    江苏农业科学

    江苏农业科学

    2017年45卷22期

    32-37页

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