换一批摘要EST是携带有表达基因部分遗传信息的cDNA片段,EST聚类是将来自同一个基因的具有重叠部分的EST整合到单一的类中,是进行后续基因表达数据分析的必要步骤.传统的串行聚类方法的计算复杂度高,对内存要求大,不适于进行大规模聚类计算.本文主要介绍了EST聚类的并行处理方式、软硬件支持环境,适用于大规模EST聚类的并行算法和软件,比较了几种现有软件的算法、计算速度和内存要求等,并讨论了现有大规模聚类算法的优缺点.
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栏目名称
DOI
10.3969/j.issn.1674-9960.2006.06.025
发布时间
2007-02-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点基础研究发展计划（973计划）（2003CB715900）
国家高技术研究发展计划（863计划）（2002AA234021）
国家自然科学基金（90208017）
国防科技重点实验室项目（51484050304JB4401）
北京市科技新星计划（2005A44）
云南农业大学学院科研项目（0401001;0402013）
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