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我国东部沿海地区水产品中副溶血弧菌分离株的基于碱基序列和肽链序列的多位点序列分型研究

Typing of Vibrio parahaemolyticus strains from aquatic products in East-China coastal areas based on multilocus sequence typing and AA-multilocus sequence typing

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摘要目的：了解2007～2012年来自我国东部沿海地区水产品中的副溶血弧菌分离株的毒力基因携带情况和菌株克隆群关系构成。方法收集2007～2012年间来自广东省、福建省、上海市、江苏省、山东省、北京市的水产品，分离自水产品中的副溶血弧菌株，经基于 tlh 基因荧光 PCR 鉴定为副溶血弧菌共79株。采用荧光 PCR 方法对其进行了毒力基因耐热直接溶血素（tdh）、耐热直接溶血素相关溶血素（trh）及流行组标识基因 orf8检测，采用国际推荐的多基因座序列分型（MLST）方法对菌株进行亚群分析和克隆复合体分析，并构建基于 ST 型和 pST 型的最小生成树，根据 eBURST 进行克隆群复合体分析。结果在79株水产品分离株中，tlh 均为阳性，8．86％（7／79）的分离株 tdh 阳性，orf8基因的携带率为8．86％。此79株副溶血弧菌分离株分属于69个 ST 型，3个克隆群复合体，62个单体。在基于肽链的多位序列分型时，此79株副溶血弧菌分离株可分为23个 pST 型，包括1个克隆群复合体，2个单体。去重组后剩余363个单核苷酸多态性（SNP）位点，以此363个 SNP 位点进行分型，可分为68个 pattern型。结论来自我国东部沿海地区的水产品中分离的副溶血弧菌具有高度多态性，但毒力基因携带率较低，MLST分型时以 ST3型为多，AA-MLST 分型时以 pST1型为主。