换一批普罗维登斯菌中新型别质粒IncpPrY2001的遗传特性研究
Genetic characterization of plasmids of novel group IncpPrY2001 from Providencia
摘要目的 旨在揭示普罗维登斯菌中质粒不相容群IncpPrY2001的基因组结构和遗传特征.方法 16S rDNA初步鉴定菌种后,将菌株送二代和三代测序,得到测序数据后进行平均核苷酸一致性(ANI)比对,最终核定菌种;VITEK 2仪器检测细菌的最小抑菌浓度(MIC)值;随后进行全基因组测序,获得细菌的全基因组序列,通过精细注释及比较基因组学分析,确定耐药基因所在基因环境.结果 该研究指定了1个新的质粒型别IncpPrY2001.IncpPrY2001型质粒与参考质粒pPrY2001具有相似的骨架保守区,但插入区存在差异.IncpPrY2001型质粒的插入区表现出了显著的多样性,这表明质粒内部存在大量的基因获得和缺失,包括5个Tn1696和1个Tn7相关的区域.在IncpPrY2001型质粒中发现了多种抗生素耐药基因(ARG),涉及对至少8类12种的抗生素的耐药性.发现包含In1806和In1807在内的2个新的可移动遗传元件(MGE).结论 IncpPrY2001型质粒中插入了大量携带耐药基因的MGE,有助于ARG的积累和分布,同时增强了普罗维登斯菌株在药物选择压力下的生存能力.
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关键词
普罗维登斯菌IncpPrY2001型质粒单元转座子抗生素耐药基因多药耐药ProvidenciaIncpPrY2001 plasmidsunit transposonsantimicrobial resistance genesmulti-drug resisitance
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DOI
10.7644/j.issn.1674-9960.2024.03.005
发布时间
2024-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
基金项目
国家重点研发计划（2022YFC2303900）
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