草菇不同菌株木聚糖酶xyn基因的表达及其酶活性分析
Expression analysis of xyn and activity determination of xylanase in different Volvariella volvacea strains
摘要木聚糖酶是半纤维素酶系的重要组成部分,能够分解水稻、小麦等农作物秸秆中的半纤维素.研究探讨木聚糖酶相关基因及其功能,为进一步探讨木聚糖酶与草菇生物转化率之间的关系提供理论依据.首先通过生物信息学手段构建了草菇2个木聚糖酶基因xyn1和xynll编码氨基酸序列的系统进化树,然后从生物转化率不同的草菇菌株分别提取各自的RNA,反转录为cDNA后,采用实时荧光定量PCR技术分析了xyn1和xynll基因的转录表达情况;最后应用DNS法对这些菌株中的木聚糖酶活性进行了测定.研究结果表明,xyn1编码的氨基酸序列与草腐菌相似性较高,而xynlI编码的氨基酸序列与木腐菌遗传差异较小.在木聚糖酶活性测定和实时荧光定量PCR结果中,不同菌株的木聚糖酶活性趋势与xynll的转录表达趋势相似,均呈现依次递减.草菇的木聚糖酶活性与其生物转化率之间存在正相关性,推测草菇不同菌株木聚糖酶活性差异可能表现在转录水平上的差异.
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