换一批草菇exo-β-1,3-葡聚糖酶基因可变剪接体的克隆与表达分析
Cloning and expression analysis of different alternative splicing variants of the exo-β-1,3-glucanase gene in Volvariella volvacea
摘要可变剪接是基因表达调控的一种重要方式.本研究利用RT-PCR克隆鉴定到草菇exo-β-1,3-葡聚糖酶基因(exg2)的4种可变剪接体(exg2V1,exg2V2,exg2V3和exg2V4),其中,exg2V1第7个内含子保留;exg2V2第11个内含子保留同时剪切掉第12个外显子的后58bp;exg2V3同时保留第7个和第17个内含子;exg2V4同时保留第2、第9和第17个内含子.4种剪接体均在可变剪接位点提前出现终止密码子,导致预测编码的氨基酸序列中包含不完整的结构域.定量PCR结果显示:草菇5个发育时期中,4种可变剪接体表达量均比标准剪接体exg2低,但4种可变剪接体的表达也表现出一定的时期和组织差异性.初步推断发现的草菇exg2基因4种可变剪接体均为无义介导的mRNA降解,通过此方式达到对exg2基因标准剪接转录本的精准调控.
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关键词
可变剪接子实体发育无义介导的mRNA降解定量PCRalternative splicingfruiting body developmentnonsense-mediated mRNA decayquantitative PCR
栏目名称
DOI
10.13346/j.mycosystema.170146
发布时间
2018-04-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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