黑茶中"金花菌"线粒体基因组序列测定及系统发育分析
Sequencing and phylogenetic analysis of the mitochondrial genome of the"jinhua-jun"isolated from fermented dark tea
摘要本研究对黑茶中优势微生物"金花菌"线粒体基因序列进行测定与生物信息分析,并探究其与近缘种微生物的系统发育关系.结果表明,"金花菌"线粒体基因组是一条全长77 649bp的环状DNA分子,其ATCG 4种碱基所占比例分别为34.14%、37.64%、15.61%、12.61%,具有显著的A-T偏向性.基因组共编码42个基因(15个蛋白质编码基因,2个rRNA基因和25个tRNA),与近缘种相比缺失了trnT-TGT且多了1个trnM-CAT拷贝,排列顺序上则较为保守.蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为Leu、lle、Ser、Phe和Val;RSCU频率最高的4个密码子依次是UUA、AUA、UUU和AAU.25个tRNA基因均可形成典型三叶草结构,并存在有35处G-U错配.系统发育分析表明:与"金花菌"分类地位上最密切是Aspergillus pseudoglaucus.依据菌株形态学与系统发育分析的结果,本研究支持将"金花菌"归类于Aspergillus属并使用A.cristatus这一名称的分类观点.
更多相关知识
- 浏览0
- 被引8
- 下载0

相似文献
- 中文期刊
- 外文期刊
- 学位论文
- 会议论文


换一批



