用5′LongSAGE标签产生的长cDNA片段分析西方蜜蜂(Apis mellifera)基因座LOC727225的选择性剪接

Alternative Splicing Pattern of Apis mellifera Gene Locus LOC727225 Revealed by 5′LongSAGE Tag-gernerated cDNA Fragments

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摘要选择性剪接是真核生物产生蛋白多样性的一个重要机制,并能通过产生不同的剪接本来调节基因在不同组织或发育阶段的表达而发挥其作用.本研究采用3条5 ′ LongSAGE标签序列作为上游引物,通过RT - PCR克隆了西方蜜蜂(Apis mellifera)的一个预测基因座LOC727225的4条cDNA序列(GenBank登录号:JN627500至JN627503).将cDNA序列对蜜蜂基因组作图发现,雄蜂头部中该基因的mRNA前体经由两种不同的剪接方式产生的2个长度不同的剪接本,其中较短的剪接本编码一个功能未知的新蛋白,而较大剪接本的推导产物蛋白与分支酸合酶和神经胰蛋白酶具有序列相似性.5 ′LongSAGE标签数据显示,LOC727225在成年雄蜂头部的表达水平非常高,RNA PolⅡ可从该基因的6个不同的转录起始位点(TSS)上以不同效率起始转录,其中在2个优势TSS上所起始的pre - mRNA被剪接成较小的剪接本,其数量占该基因成熟mRNA分子总量的90％.启动子序列分析显示,LOC727225是受细胞周期转录因子E2F和StuAP调控的靶基因,该基因可能在蜜蜂的细胞增殖中起重要作用.研究首次证实了基因座LOC727225的选择性剪接和选择性起始,结果为深入探索该基因的功能奠定了基础.