摘要目的 阐明胃癌(gastric cancer,GC)组织与癌旁组织之间的基因表达差异,并评估其预后价值.方法 从基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库中选取 3 个GC微阵列数据集(GSE79973、GSE54129和GSE19826),limma包分析GC和癌旁组织间基因表达差异;使用ClusterProfiler包对筛选出的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)进行了基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)途径富集分析.使用STRING数据库检索DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)信息,构建PPI网络,利用Cytoscape的cytohubba插件识别网络中的重要基因模块或枢纽基因.结果 GSE79973、GSE54129 和GSE19826 数据集分别鉴定出 886、2 369 和 759 个DEGs;上调的DEGs主要与细胞外基质、内质网和基底膜结构相关,且富集于PI3K-AKT号通路;下调的DEGs主要定位于细胞顶端、质膜和细胞皮层部分,且参与胃酸分泌,视黄醇代谢和药物代谢细胞色素P450 途径.鉴定出关键节点分子如COL1A1、COL1A2、COL3A1、COL5A1 和COL6A3 等.这些关键分子在配对和非配对GC组织中均上调,差异有统计学意义(P＜0.001),且其高表达与较差的总生存率(overall survival,OS)相关,差异有统计学意义(P＜0.001),反之亦然.其中,COL1A1 和COL3A1 显示出很强的诊断能力.结论 本研究揭示了GC组织与癌旁组织之间的关键差异基因表达,初步确定了这些基因作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力.