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结直肠癌组织中CD133及LGR5蛋白的表达及差异表达基因分析

Analysis on expression of CD133 and LGR5 protein and differential expressed genes in colorectal cancer tissues

摘要目的 研究结直肠癌组织CD133和LGR5蛋白以及差异表达基因的表达情况.方法 采用免疫组化法检测正常结直肠、结直肠息肉、结直肠癌组织中CD133和LGR5蛋白表达水平.采用生物信息学手段分析结直肠癌细胞转录组数据,进行差异表达基因筛选、GO分析及KEGG分析,分析CD133及LGR5基因在结直肠癌、大肠癌及结直肠癌伴肝转移细胞中的表达情况,以及结直肠癌患者预后生存率.结果 与正常结直肠组织和息肉组织比较,结直肠癌组织中CD133及LGR5蛋白的表达均明显升高(P<0.05).分析GSE2509数据库的转录组表达谱共筛选到1265个差异表达基因,其中,与结肠癌SW480细胞系相比,CD133和LGR5基因在强侵袭性的结肠癌SW620细胞系中均呈高表达.分析GSE21510的转录表达谱,与正常对照相比,结直肠癌细胞的CD133及LGR5基因亦呈高表达.对GSE72718数据库的表达谱数据进行分析,比较原发性结直肠癌细胞以及结直肠癌伴肝转移细胞的表达谱,其中CD133基因差异有统计学意义(P<0.05),LGR5基因差异无统计学意义(P>0.05).对GSE12945数据库中结直肠癌肿瘤组织表达谱进行分析,以及对患者进行生存分析,发现CD133和LGR5基因表达水平与结直肠癌患者总体生存率无关(P>0.05).结论 CD133和LGR5蛋白在结直肠癌组织中高表达,与肿瘤侵袭性相关.

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作者 周龙翔 [1] 饶雷平 [1] 俞冬 [1] 徐军 [1] 吴忠新 [1] 疏东升 [2] 学术成果认领
作者单位 上海健康医学院附属上海市第六人民医院金山分院,上海 201599 [1] 上海市松江区泗泾医院,上海 201601 [2]
分类号 R735.3
栏目名称 论著
DOI 10.3969/j.issn.1672-9455.2020.20.004
发布时间 2020-10-30
基金项目
上海市卫生和计划生育委员会科研项目 上海市金山区科委课题
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