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基于焦磷酸测序的CYP2C19*2、CYP2C19*3基因分型方法性能验证

Performance verification of CYP2C19?2 and CYP2C19?3 genotyping method based on pyrophosphate sequencing

摘要目的 对细胞色素P4502C19(CYP2C19)?2和CYP2C19?3单核苷酸多态性分型的实验室自建焦磷酸测序法进行性能验证,确保其能为临床提供准确可靠的结果.方法 通过对梯度稀释的杂合型基因组DNA(gDNA)标本(10.0、2.0、0.4 ng/μL)进行检测,评价方法的最低检测浓度;比较焦磷酸测序和Sanger测序结果,评价方法的准确度;将经焦磷酸测序验证的野生型gDNA标本进行Sanger测序,评价方法的特异度;对杂合型gDNA标本重复检测4次,评价方法的重复性.结果 焦磷酸测序检测CYP2C19?2和CYP2C19?3单核苷酸多态性的最低检测浓度为0.4 ng/μL;20份临床gDNA标本的焦磷酸测序结果与San-ger测序结果一致,准确度为100%;10份野生型的临床gDNA标本经Sanger测序验证均为野生型,特异度为100%;分别对CYP2C19?2和CYP2C19?3的杂合型gDNA标本重复检测4次,重复性好,变异系数均<5%.结论 焦磷酸测序检测CYP2C19?2和CYP2C19?3单核苷酸多态性的结果准确可靠,能够为临床使用氯吡格雷、质子泵抑制剂等药物提供个体化指导.

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分类号 R446.1
栏目名称 论著
DOI 10.3969/j.issn.1672-9455.2023.05.006
发布时间 2023-03-21
基金项目
国家自然科学基金 江苏省自然科学基金青年基金项目 东部战区总医院院内课题项目
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