单细胞RNA测序揭示角膜内皮急性损伤修复双轴协同调控机制
Single-cell RNA sequencing reveals the bi-axis synergistic regulation mechanism of acute corneal endothelial injury repair
摘要目的 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术分析大鼠角膜内皮机械损伤后修复过程中的细胞异质性、功能转化与分化轨迹,以阐明角膜内皮细胞(CECs)在有限增殖下的体内修复机制.方法 选取30只健康雄性SD大鼠作为实验对象,将其随机分为对照组(未接受手术大鼠)、D5组(手术损伤后5 d大鼠,代表炎症反应高峰期)和D10组(手术损伤后10 d大鼠,代表修复与重塑的后期阶段),每组10只.收集3组CECs进行scRNA-seq.通过聚类分析、差异表达、功能富集和拟时序分析,分析CECs亚群动态演变.结果 3组CECs共鉴定出7个功能上截然不同的亚群,命名为CECs_1~CECs_7,且这7个亚群的占比情况在CECs损伤修复的不同阶段表现出剧烈的动态变化.对照组中表达增殖相关基因的CECs_5亚群仅占3.67%,D5组中CECs_5的占比上升至13.40%.拟时序分化轨迹结果显示,在对照组,细胞的分化轨迹起始于稳态的CECs_1;D5组以CECs_2、CECs_4主导的"免疫防御轴"激活;D10组以CECs_3、CECs_6主导的"ECM重塑轴".结论 CECs损伤修复中存在"免疫防御-ECM重塑"双轴协同修复及具增殖潜能的CECs.
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